世界各國高度重視分子診斷技術的發展，基因芯片將成為新一代分子診斷試劑開發的主流。基因芯片是分子生物學、微電子、計算機等多學科結合的結晶，綜合了多種現代高精尖技術，被專家譽為“診斷行業的終極產品”。基因芯片具有同時能夠檢測多個靶點的功能，具有快速有效的特點。因而基因芯片成為新一代分子診斷試劑的主要開發方向，但其成本高、開發難度大，產品種類很少，只用于科研和藥物篩選等用途。基因芯片的大規模臨床應用還存在尚未克服的技術缺陷，主要是由于芯片診斷特異性和靈敏度低、芯片診斷成本高昂和芯片診斷配套儀器價格昂貴等原因。全球，雖然只有少數的芯片可用于臨床診斷，但國內基因芯片技術已經處于世界領跑的地位。基因芯片技術將是熒光定量PCR 檢測技術最具挑戰的潛在對手，主要是：熒光定量PCR 技術一次只能檢測一個或幾個目標基因，而基因芯片技術可以實現對大量目標基因的同時檢測。隨著人類基因組計劃的進展，基因芯片在國內外已成為研發熱點。若基因芯片技術迅速成熟并大規模產業化，將對熒光定量PCR 檢測產生較大的沖擊。不過，基因芯片的大規模臨床應用還存在尚未克服的技術缺陷，主要是由于芯片診斷特異性和靈敏度低、芯片診斷成本高昂和芯片診斷配套儀器價格昂貴等原因，預計熒光定量PCR 檢測技術在今后5 到10 年內可保持領先。
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